Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD3P31249 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD3P31249 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms