Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA2P24043 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA2P24043 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms