Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4BP23588 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms