Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms