Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XBP1P17861 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XBP1P17861 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XBP1P17861 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XBP1P17861 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XBP1P17861 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XBP1P17861 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XBP1P17861 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XBP1P17861 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XBP1P17861 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XBP1P17861 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XBP1P17861 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XBP1P17861 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XBP1P17861 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms