Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS1P17812 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms