Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms