Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms