Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms