Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms