Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA1P15085 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA1P15085 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA1P15085 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA1P15085 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPA1P15085 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA1P15085 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA1P15085 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA1P15085 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA1P15085 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms