Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC5A1P13866 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms