Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP2BP0DMP2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms