Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms