Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms