Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA1P09110 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA1P09110 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms