Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A4P08684 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms