Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRCP08575 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
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