Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOP08100 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOP08100 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOP08100 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOP08100 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOP08100 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOP08100 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOP08100 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOP08100 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOP08100 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOP08100 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOP08100 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOP08100 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOP08100 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms