Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCGP05129 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCGP05129 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms