Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms