Protein–RNA interactions for Protein: O95777

LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM8O95777 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM8O95777 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM8O95777 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM8O95777 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM8O95777 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM8O95777 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM8O95777 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM8O95777 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM8O95777 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM8O95777 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM8O95777 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM8O95777 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM8O95777 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM8O95777 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM8O95777 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM8O95777 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms