Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE8BO95263 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE8BO95263 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE8BO95263 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE8BO95263 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE8BO95263 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE8BO95263 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE8BO95263 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE8BO95263 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms