Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOO75962 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIOO75962 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIOO75962 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIOO75962 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIOO75962 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOO75962 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOO75962 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOO75962 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOO75962 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIOO75962 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIOO75962 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIOO75962 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIOO75962 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIOO75962 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIOO75962 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms