Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPP40O75818 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPP40O75818 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPP40O75818 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPP40O75818 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPP40O75818 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPP40O75818 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPP40O75818 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPP40O75818 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPP40O75818 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPP40O75818 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPP40O75818 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPP40O75818 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPP40O75818 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPP40O75818 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPP40O75818 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms