Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45BO75293 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms