Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV3LO60673 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REV3LO60673 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REV3LO60673 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REV3LO60673 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REV3LO60673 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REV3LO60673 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REV3LO60673 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REV3LO60673 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REV3LO60673 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REV3LO60673 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REV3LO60673 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REV3LO60673 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REV3LO60673 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REV3LO60673 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
REV3LO60673 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REV3LO60673 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REV3LO60673 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REV3LO60673 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REV3LO60673 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REV3LO60673 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms