Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PDE6DO43924 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6DO43924 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PDE6DO43924 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PDE6DO43924 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6DO43924 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PDE6DO43924 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PDE6DO43924 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PDE6DO43924 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6DO43924 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PDE6DO43924 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6DO43924 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6DO43924 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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