Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRNO43815 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRNO43815 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRNO43815 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRNO43815 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRNO43815 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRNO43815 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRNO43815 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRNO43815 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRNO43815 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRNO43815 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRNO43815 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRNO43815 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRNO43815 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRNO43815 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms