Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms