Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD51CO43502 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms