Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA2O43364 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms