Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI1O43347 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI1O43347 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSI1O43347 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSI1O43347 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSI1O43347 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI1O43347 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI1O43347 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI1O43347 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms