Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI2O43237 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms