Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB6O15197 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms