Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms