Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFIT3O14879 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms