Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPEO14579 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPEO14579 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPEO14579 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPEO14579 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPEO14579 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPEO14579 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPEO14579 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPEO14579 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPEO14579 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPEO14579 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPEO14579 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPEO14579 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPEO14579 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPEO14579 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPEO14579 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPEO14579 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPEO14579 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPEO14579 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPEO14579 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPEO14579 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPEO14579 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPEO14579 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPEO14579 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPEO14579 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPEO14579 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPEO14579 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPEO14579 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms