Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
O00370 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
O00370 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
O00370 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
O00370 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
O00370 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
O00370 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
O00370 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
O00370 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
O00370 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
O00370 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
O00370 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
O00370 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
O00370 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
O00370 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
O00370 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
O00370 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
O00370 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
O00370 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
O00370 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms