Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVH48-1M5A8F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms