Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3KR12 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
J3KR12 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3KR12 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3KR12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3KR12 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3KR12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3KR12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
J3KR12 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3KR12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3KR12 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms