Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCER2I3L3R5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms