Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms