Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCCD1A6NED2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms