Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSDA5PKW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms