Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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SNX13Q9Y5W8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX13Q9Y5W8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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