Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms