Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB6Q9Y5E3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms