Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1Q9Y3T6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1Q9Y3T6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms