Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms